El tejido Embebido en Parafina (TEP) es una va-liosa fuente de ADN para investigación molecular. El objetivo de este estudio fue evaluar tres protocolos para el aislamiento de ADN fijado en formol y parafinado, evaluando cantidad y calidad de DNA de muestras de corazón obtenidos del Departamento de Patología en el Hospital San Ignacio. El ADN se extrajo con Acetato de amonio, Chelex-100 y GTE (Glicina-tris-EDT A) desparafinando con diferentes técnicas. El ADN se cuantificó por espectrofotometría y se utilizó para amplificación por PCR. Los tres métodos arrojaron una alta concentración de ADN con un resultado positivo en la amplificación por PCR. De los tres métodos Chelex-100 es el más eficaz en relación a la concentración de DNA, con diferencias estadísticamente significativas en comparación con los otros dos métodos. Chelex-100 es una buena opción para la extracción de ADN de tejidos, adi-cionalmente a los resultados obtenidos en concentración y pureza, también debido a su bajo costo, la rapidez y la seguridad para ser utilizado en estudios moleculares.