Los probióticos son microorganismos vivos que confieren beneficios a la salud del huésped, cuando se consumen en cantidades adecuadas, proporcionando una acción protectora contra patógenos y beneficios nutricionales. Su uso está asociado principalmente a alimentos funcionales o suplementos dietarios que contribuyen a un mejoramiento de la salud principalmente en humanos. Sin embargo, en los últimos años se han venido estudiando nuevos usos de estos, como son la prevención y alivio de ciertas enfermedades principalmente gastrointestinales. Así mismo los probióticos se han convertido en una alternativa para el tratamiento de enfermedades infecciosas, para mitigar el efecto negativo que los antibióticos pueden generar sobre el microbioma de los pacientes. Otro de las aplicaciones que ha tomado importancia es el uso de estos en el control de patógenos tanto en las industrias alimentarias como en el sector agrícola, las cuales constantemente enfrentan problemas que generan pérdidas económicas por contaminación de estos. Por lo tanto, el objetivo de esta revisión bibliográfica fue identificar y compilar los últimos estudios e investigaciones en las cuales se evidencie el papel que juegan los probióticos en la solución de dichos problemas, además se determinaron los mecanismos de acción de cepas probióticas frente a patógenos y los principales patógenos sobre los cuales actúan los probióticos utilizados como agentes de biocontrol en la industria alimentaria, agrícola y salud humana.