Clonación, secuenciación y caracterización bioinformática de candidatos A microRNAs de yuca (Manihot esculenta Crantz Var. Tai 16)

Abstract

Los microRNAs (miRNAs) son smallRNAs endógenos que regulan la expresión de genes en plantas y animales. Estos RNAs de ~21 nucleótidos son sintetizados a partir de secuencias intrónicas o a partir de genes de microRNAs por la RNA pol II, cuyo precursor forma una estructura tallo y asa, el cual es a su vez procesado por la enzima Dicer 1 hasta secuencias más cortas que son reclutadas por el complejo RISC, el cual dirige la degradación de mRNAs blanco. Estos pequeños transcritos han sido descubiertos mediante predicciones bioinformáticas o mediante su clonación y secuenciación, y se ha visto que los miRNAs en plantas están involucrados en múltiples procesos biológicos, incluyendo diferenciación celular, desarrollo de órganos, cambios de fases, señalización, respuesta a estrés biótico y abiótico, entre otros. Por otro lado, la yuca (Manihot esculenta Crantz) es considerada como uno de los cultivos más importantes en las regiones tropicales del mundo. En este sentido, este estudio representa el primer esfuerzo por identificar miRNAs en yuca a través de una aproximación experimental (clonación y secuenciación) y posterior análisis bioinformático, en el cual se obtuvieron secuencias en 6 familias diferentes, una de las cuales, fue validada como candidato a microRNA basada en el genoma de Ricinus communis. Esta secuencia puede ser un transcrito cuyo origen es a partir de transposones, por lo que se explicaría el porqué está presente en la mayoría de los clones secuenciados y podría estar involucrada con procesos asociados a la fotosíntesis.