Genómica comparativa y análisis sintético del operón srfA para la producción de surfactina en cepas Bacillus y desarrollo de estrategia para su producción
Description
Se desarrolló una propuesta de experimentos para la producción de surfactina a partir de la bacteria Bacillus subtilis subsp. subtilis 168, la cual fue seleccionada utilizando herramientas de bioinformática, como genómica comparativa y análisis de sinténias, sumado al análisis el mecanismo de transcripción que ocurre en la cepa nativa para los genes que son de importancia en la biosíntesis de la surfactina. B. subtilis subsp. subtilis 168 es de las especies de Bacillus que poseen su genoma anotado en diversas plataformas, además es con el que más se han realizado experimentos en condiciones y con modificaciones para la producción de surfactina, sumado al hecho de que los mejores rendimientos registrados han sido con el mencionado. Se propone lograr la sobreexpresión del operón srfA al cambiar el promotor nativo a uno constitutivo a través de la recombinación homóloga forzada después de la utilización de sistema CRISPR-Cas9 de reemplazo. Otros dos importantes genes en la resistencia y exportación extracelular del metabolito son el operón liaIHGFSR y el gen swrC para los cuales se propone utilizar el sistema CRISPR-dCas9-SAM, para activación de la trascripción.ITESO, A.C.