La transformación antrópica de los ecosistemas es una de las principales amenazas para la biodiversidad. Este fenómeno ha afectado de gran manera a poblaciones, comunidades, procesos ecológicos e incluso, las contribuciones ecológicas que la naturaleza produce a la sociedad, donde la fragmentación y la pérdida de hábitat han sido de los fenómenos con mayores impactos sobre los ambientes naturales. El presente estudio buscó realizar una aproximación desde la integración de la ecología de comunidades, la ecología de la conservación, la ecología del paisaje y modelos de conectividad funcional, indagando por el estado de conectividad funcional en el Cañón del Río Combeima, Ibagué, Tolima (Andes colombianos), para el grupo de las aves, zona donde no es ajena la dinámica de cambios en el paisaje. Para ello, se realizaron muestreos en tres coberturas (unidades de análisis) que se priorizaron por su predominancia en el territorio (bosque, cultivo y mosaico), comprendiendo y comparando la riqueza y composición de los ensamblajes de aves entre las coberturas. Posteriormente, se realizó una identificación de especies Valor Objeto de Conservación (VOC), a las que se le realizaron modelos de conectividad funcional a escala de paisaje por medio de Sistemas de Información Geográficos (SIG). Se registraron un total de 390 individuos comprendidos por 51 especies diferentes. De las tres coberturas contrastadas se encontró que el mosaico fue la que mayor registro de riqueza y abundancias presentó. La diversidad α fue alta (poca dominancia) para las tres unidades de análisis, y para la diversidad β se encontró un alto grado de similaridad entre mosaico y cultivo. A partir de los resultados de los censos y análisis por coberturas fueron identificados ocho VOCs a partir de criterios de vulnerabilidad y amenaza, para todos los VOCs se ejecutó un análisis de conectividad funcional basado en una matriz de resistencias. Los escenarios encontrados de conectividad funcional evidenciaron un alto porcentaje de conectividad (alta conectividad), lo que ayuda a determinar el buen estado actual del paisaje en la zona de estudio. Finalmente, se plantearon posibles estrategias de manejo basadas en la interdisciplinaridad que puedan fomentar la conservación de la biodiversidad y los procesos ecológicos apoyados en un eje transversal, la conectividad.