En este trabajo de grado, se presenta una solución para automatizar un Sistema de celdas de combustible PEM de baja potencia. Con base en experimentos realizados con el sistema de celdas de combustible, se evidencia que es posible modificar su comportamiento cuando hay variación de flujo de hidrógeno entrante. Teniendo en cuenta que el flujo de hidrógeno es generado por un electrolizador, se propone una solución poco convencional la cual consiste en manipular la energía eléctrica que pasa a través del electrolizador, con el objetivo de modificar la producción de hidrógeno y así, controlar el suministro del gas.