Caracterización genética de la anemia de Fanconi en población colombiana, relación con el fenotipo clínico y citogenético

Abstract

Anemia de Fanconi (AF) es causada por defectos en genes que participan en una ruta de reparación del genoma y en la regulación de procesos en el ciclo celular, de esta manera, diferentes aspectos del desarrollo y la sobrevida del individuo resultan afectados. AF es altamente heterogénea con fenotipos severos hasta fenotipos leves o ausentes que dificultan su diagnóstico. Característicamente los afectados presentan malformaciones congénitas, aplasia medular, predisposición a cáncer, e inestabilidad cromosómica. Debido al desconocimiento de la etiología de AF en Colombia, se propuso caracterizar individuos afectados por AF, identificados de pacientes con diagnóstico o sospecha clínica de la enfermedad. Se reclutaron 157 individuos con diagnóstico o sospecha clínica de AF, 19 con asociación VACTERL, 15 hermanos de casos AF y 34 individuos sanos. Se registraron las características clínicas y se aplicaron las pruebas citogenéticas de hipersensibilidad a diepoxibutano. La caracterización molecular de los casos hipersensibles (AF) fue realizada por MLPA para FANCA, NGS para panel de genes FANC y secuenciación Sanger. 43 casos fueron clasificados AF por prueba citogenética y en 24 se determinó el genotipo. 22(91.6%) tuvieron alteraciones en FANCA, 1(4.2%) en FANCB y 1(4.2%) en FANCD2. Las variantes identificadas fueron deleciones grandes, y mutaciones tipo INDEL y de cambio de base. 10(47.6%) variantes fueron nuevas. Las alteraciones clínicas más comunes fueron hematológicas, esqueléticas, cutáneas, faciales, y de talla. Este estudio informa por primera vez en Colombia sobre las características genéticas de la enfermedad confirmándose una prevalencia elevada de alteraciones en FANCA (91.6%), mayor al promedio informado para otras poblaciones. La mayoría de variantes fueron únicas, aunque se destaca una variante FANCA identificada en varios casos con procedencia regional común.