Este trabajo busca, a partir de la experiencia de dos consejos comunitarios: el de Río Quito en el Chocó y La Toma en el Norte del Cauca, revisar de qué manera estas comunidades se han venido organizando en torno a la protección y gobierno de sus territorios. El trabajo desarrolla un análisis comparativo que tiene como punto de partida la comprensión del territorio como una construcción social y colectiva. Desde esta perspectiva, se pregunta sobre las principales amenazas que afecta cada uno de los territorios y las estrategias, que las comunidades han apropiado de manera colectiva para la defensa y protección de su territorio y por tanto de sus formas de vida.