Estandarización de condiciones de amplificación de fragmentos de ADN mitocondrial de especímenes colombianos del perico carisucio (Eupsittula pertinax)

Abstract

Eupsittula pertinax se encuentra dentro de las aves con mayor número de incautaciones en la escena del tráfico ilegal en Colombia. Estos especímenes de ser liberados retornarían a los rangos de distribución de la especie, sin embargo, morfológica y geográficamente no hay certeza sobre la subespecie a la que pertenecen. El uso de herramientas moleculares podría solucionar este vacío de conocimiento, para este propósito se estandarizaron las condiciones de la PCR para cuatro marcadores mitocondriales (COI, 12S, 16S y ND2) que a futuro sean base para la identificación de las subespecies de E. pertinax. Se extrajo el ADN de 33 individuos, a partir de las almohadillas plantares y uñas de ejemplares de colecciones biológicas (12) y sangre de individuos decomisados por tráfico residentes en hogares de paso (21). Se estandarizaron las temperaturas de hibridación óptimas para los primers de cada marcador. Se obtuvieron en total 33 secuencias correspondientes a 14 individuos de E.pertinax y uno de Aratinga weddellii. Se realizaron análisis de distancias de estas secuencias mediante árboles Neighbor Joining (NJ) individuales para cada marcador como para concatenaciones entre marcadores