Los canales o ríos urbanos presentan cambios geométricos en todo su recorrido debido a la acumulación de sedimentos y a la erosión principalmente En este trabajo se hace uso de la dinámica de fluidos computacional (CFD), como herramienta de entendimiento y representación de estos fenómenos en el río Arzobispo, en Bogotá (Colombia). Con este fin, se hace uso de un modelo numérico tridimendional bifásico con la herramienta de CFD Ansys-FLUENT para dicho hidrosistema urbano. Se incluye el modelo multifase de Volume of Fluids (VOF) con el objetivo de representar adecuadamente el flujo en la superficie libre, además de observar la interacción entre agua-aire. Igualmente se presenta el modelo de turbulencia empleado k-?, con el cual se da solución a las ecuaciones promediadas de Reynolds (RANS). Se comparan mallas compuestas por diferentes tipos de elementos, en donde se determina el tipo de malla óptimo para el modelo. Se realiza un análisis de sensibilidad de los parámetros de las ecuaciones de turbulencia, encontrando que tienen gran influencia en los resultados.