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Predição computacional da estrutura terciária das proteínas humanas Hsp27, αB-cristalina e HspB8.

dc.contributornulleng
dc.contributorEl presente trabajo es producto del proyecto 025-ME-2007 subvencionado por el Centro de Desarrollo Científico Humanístico y Tecnológico (CDCHT) de la Universidad Centroccidental Lisandro Alvarado, Barquisimeto, Venezuela.spa
dc.contributornullpor
dc.contributor.authorSáenz-Suárez, Homero; Unidad de Biología Celular y Microscopía. Decanato de Ciencias de la Salud. Universidad Centroccidental Lisandro Alvarado. Barquisimeto
dc.contributor.authorLareo, Leonardo René; Grupo de Bioquímica Computacional y Bioinformática, Departamento de Bioquímica, Facultad de Ciencias. Pontificia Universidad Javeriana. Bogotá, D.C.
dc.contributor.authorOribio-Quinto, Carlos; Unidad de Biología Celular y Microscopía. Decanato de Ciencias de la Salud. Universidad Centroccidental Lisandro Alvarado. Barquisimeto
dc.contributor.authorMartínez-Mendoza, Juan; Unidad de Biología Celular y Microscopía. Decanato de Ciencias de la Salud. Universidad Centroccidental Lisandro Alvarado. Barquisimeto,
dc.contributor.authorChávez-Zobel, Aura; Unidad de Biología Celular y Microscopía. Decanato de Ciencias de la Salud. Universidad Centroccidental Lisandro Alvarado. Barquisimeto,
dc.date.accessioned2018-02-24T15:59:32Z
dc.date.accessioned2020-04-15T18:08:15Z
dc.date.accessioned2023-05-11T17:37:42Z
dc.date.available2018-02-24T15:59:32Z
dc.date.available2020-04-15T18:08:15Z
dc.date.available2023-05-11T17:37:42Z
dc.date.created2011-01-01
dc.identifierhttp://revistas.javeriana.edu.co/index.php/scientarium/article/view/1347
dc.identifier10.11144/javeriana.SC16-1.cpot
dc.identifier.issn2027-1352
dc.identifier.issn0122-7483
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12032/111008
dc.descriptionObjetivo. Realizar predições computacionais da estrutura das proteínas humanas Hsp27, αB–cristalina e HspB8. Materiais e métodos. A predição da estrutura secundária foi obtida através de um consenso dos programas de predição secundária GOR 4, nnPred, Sspro, APSSP2, JPredict, Porter, Prof, SOPMA, HNN e Psi-Pred.  Os modelos de estrutura terciária foram desenvolvidos a partir de fragmentos homólogos de proteínas com estrutura terciária conhecida que foram obtidos por alinhamentos múltiplos. Utilizando a seqüência primária foram obtidos perfis de antigenicidade das proteínas nativas e foram analisados os perfis de hidrofobicidade, polaridade, flexibilidade e acessibilidade, tanto da proteína nativa, como das mutantes. Resultados. As predições de estrutura secundária e terciária das proteínas estudadas mostram que nos três casos, mais de 65% são regiões em coil, 20-25% de folha pregueada e inferior a 10% em alfa-hélice. A análise da estrutura primária mostra que pelo menos um dos perfis estudados, em cada mutação está alterado. Conclusões. A análise comparativa da estrutura sugere que as mutações afetam a solubilidade das proteínas mutantes e, assim, sua função como chaperones moleculares. Palavras-chave: Hsp27, αB-crystalina, HspB8, predição da estrutura secundária, modelo computacional estrutura terciária.por
dc.description.abstractObjetivo. Realizar predicciones computacionales de estructura de las proteínas humanas Hsp27, αB cristalina y HspB8. Materiales y métodos. La predicción de la estructura secundaria se obtuvo mediante un consenso de los programas de predicción secundaria GOR 4,nnPred,Sspro, APSSP2, JPredict, Porter, Prof, SOPMA, HNN y Psi-Pred. Los modelos de estructura terciaria se elaboraron a partir de fragmentos homólogos de proteínas con estructura terciaria conocida que fueron obtenidos por múltiples alineamientos. Empleando la secuencia primaria se obtuvieron perfiles de antigenicidad de las proteínas nativas y fueron analizados los perfiles de hidrofobicidad, polaridad, flexibilidad, accesibilidad tanto de las proteínas nativas como de las mutadas. Resultados. Las predicciones de estructura secundaria y terciariade las proteínas estudiadas muestran que en los tres casos, más del 65% son regiones en coil, 20-25% en hoja plegada y menos del 10% en alfa hélice. Los análisis de estructura primaria muestran que al menos uno de los perfiles estudiados, en cada mutación está alterado. Conclusiones. Los análisis comparativos de estructura sugieren que las mutaciones afectan la solubilidad de las proteínas mutadas y con ello su función como chaperonas moleculares. Palabras clave: Hsp27, αB-cristalina, HspB8, predicción de estructura secundaria, modelo computacional estructura terciaria.spa
dc.formatPDFspa
dc.format.mimetypeapplication/pdfspa
dc.format.mimetypetext/htmlspa
dc.language.isoeng
dc.publisherPontificia Universidad Javerianaeng
dc.relation.urihttp://revistas.javeriana.edu.co/index.php/scientarium/article/view/1347/813
dc.relation.urihttp://revistas.javeriana.edu.co/index.php/scientarium/article/view/1347/4278
dc.subjectnullspa
dc.subjectHsp27, αB-cristalline, HspB8, prediction of secondary structure, computational model of tertiary structurespa
dc.subjectnullspa
dc.titlePredicción computacional de estructura terciaria de las proteínas humanas Hsp27, αB-cristalina y HspB8spa
dc.titlePredição computacional da estrutura terciária das proteínas humanas Hsp27, αB-cristalina e HspB8.por


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